Les champignons du Boisé du Tremblay

Rien de nouveau pour les champignons. Le guide "Fungi of Boisé du Tremblay" s'en tient aux 22 espèces déjà identifiées.

Les reptiles, amphibiens et poissons du Boisé du Tremblay

Du côté des vertébrés poïkilothermes (À sang froid), rien n'a changé cette année dans le guide "Reptiles, Amphibians and Fishes of Boisé du Tremblay" ; nous en sommes toujours à six espèces de serpents, trois de grenouilles et deux de poissons.

Je profite tout de même de l'occasion pour faire une petite mise au point. Chaque fois que j'ajoute une couleuvre rayée à la liste des espèces observées dans le boisé, on me corrige, fort probablement avec raison, qu'il s'agit d'une couleuvre rayée de l'Est. La différence entre les deux est que la couleuvre rayée est le nom français de l'espèce Thamnophis sirtalis alors que la couleuvre rayée de l'Est est celui de la sous-espèce Thamnophis sirtalis sirtalis ; une précision supplémentaire donc.

Quand je suis d'humeur taquine, j'aime demander à mon correcteur quels critères de la photo lui permettent d'identifier la sous-espèce. On me répond inévitablement : le patron de couleur et la distribution géographique. Si le second est certainement le plus valable, il reste néanmoins approximatif puisque les aires de distribution bougent, se chevauchent et que les sous-espèces s'hybrident fréquemment dans les zones de chevauchement.  Quant aux critères morphologiques, il faut malheureusement plus qu'un patron de couleur pour identifier la sous-espèce d'une couleuvre rayée (la thèse citée dans les références donne une bonne idée de la question). 

En fait, on dénombre aujourd'hui 13 ou 14 sous-espèces de couleuvres rayées réparties dans toute l'Amérique du Nord, dont cinq, je crois, au Canada. La plus proche d'ici (Longueuil), Thamnophis sirtalis pallidus est même en Gaspésie. Cette classification a été établie à partir de critères morphologiques précis (qui n'apparaissent pas toujours sur une photo) parmi lesquels : la coloration des bandes dorsales et latérales, les motifs des écailles, la taille ou les proportions corporelles et la distribution géographique. C'est la méthode classique, mais ancienne, de distinction des espèces vivantes.  

Cependant, depuis que l'on sait interroger l'ADN, cette classification est sujette à controverse dans le monde des scientifiques qui s'intéressent à la phylogénie de cette couleuvre et à l'histoire de sa conquête du continent. On s'est même aperçu que les données génétiques ne soutiennent pas vraiment la division taxonomique établie sur des critères morphologiques. Ainsi, beaucoup de sous-espèces ne correspondent pas à des clades génétiques monophylétiques ; ce qui signifie en gros qu'une sous-espèce bien définie morphologiquement regroupe plusieurs familles génétiques. À l'opposé, des sous-espèces différentes morphologiquement peuvent être génétiquement imbriquées. Et enfin, des lignées génétiques bien différenciées ne correspondent à aucune sous-espèce décrite.

En fait, ce qui fait consensus dans la science des couleuvres rayées est que l'espèce est particulièrement polymorphe et que nous avons défini beaucoup trop de sous-espèces. 

Références:

• Boundy, J. (1999) Systematics of the Common Garter Snake, Thamnophis Sirtalis. Doctor of Philosophy. Louisiana State University and Agricultural & Mechanical College. Disponible sur: https://doi.org/10.31390/gradschool_disstheses.7070.
• Hallas, J.M., Parchman, T.L. et Feldman, C.R. (2022) « Phylogenomic analyses resolve relationships among garter snakes (Thamnophis: Natricinae: Colubridae) and elucidate biogeographic history and morphological evolution », Molecular Phylogenetics and Evolution, 167, p. 107374. Disponible sur: https://doi.org/10.1016/j.ympev.2021.107374.
• Janzen, F.J. et al. (2002) « Molecular phylogeography of common garter snakes ( Thamnophis sirtalis ) in western North America: implications for regional historical forces », Molecular Ecology, 11(9), p. 1739‑1751. Disponible sur: https://doi.org/10.1046/j.1365-294X.2002.01571.x.
• Jones, L.N., Leaché, A.D. et Burbrink, F.T. (2023) « Biogeographic barriers and historic climate shape the phylogeography and demography of the common gartersnake », Journal of Biogeography, 50(12), p. 2012‑2029. Disponible sur: https://doi.org/10.1111/jbi.14709.
• Placyk Jr., J.S. et al. (2007) « Post-glacial recolonization of the Great Lakes region by the common gartersnake (Thamnophis sirtalis) inferred from mtDNA sequences », Molecular Phylogenetics and Evolution, 43(2), p. 452‑467. Disponible sur: https://doi.org/10.1016/j.ympev.2006.10.023.

Les mammifères du Boisé du Tremblay

L'année 2025 a été riche en observations puisque les visiteurs naturalistes du Boisé du Tremblay ont ajouté 4,5 espèces de mammifères au guide "Mammals of Boisé du Tremblay". 

Je vous explique le demi dans un instant, mais tout de suite, je voudrais souligner le travail de Vincent Auclair, acousticien spécialiste des chiroptères, qui ajoute deux espèces de chauve-souris à la biodiversité du Boisé du Tremblay: le Murin argenté et la Sérotine brune.

Parmi les ajouts, il faut aussi signaler deux représentants des mustélidés : l'Hermine d'Amérique et le Vison d'Amérique.

Passons maintenant à l'explication de la demi-espèce supplémentaire. En réalité, ce demi fait référence à une espèce à part entière, mais souligne une approximation concernant son identification. Plus clairement, jusqu'à présent, seule la Souris sylvestre (Peromyscus maniculatus) avait été rapportée dans le boisé. Étrangement, aucune Souris à pattes blanches (Peromyscus leucopus) n'y avait été vue. Pourtant, ces deux souris partagent souvent le même habitat et des habitudes de vie très similaires, au point même de parfois se plaire et de s'accoupler (cela reste encore exceptionnel au Québec). 

Tout ça pour vous dire comme elles sont semblables. Néanmoins, cela n'empêchait pas quelques prétentieux, dont je faisais partie, d'imaginer pouvoir les distinguer. Eh bien, sachez que si vous vous contentez de les regarder, il n'y a qu'une chance sur deux que vous arriviez à les identifier correctement. En d'autres mots, c'est pile ou face.

En effet, seule une analyse génétique permet de les identifier avec certitude. Évidemment, c'est une méthode longue et impossible à mettre en œuvre sur le terrain. Aussi, quelques biologistes sont parvenus, localement, à établir une équation combinant quelques mensurations clés comme la longueur du crâne, le rapport longueur de la queue / longueur du corps, le poids, la longueur de l'oreille et la longueur de la patte postérieure, afin d'obtenir une identification fiable à partir de critères mesurables sur le terrain. Dans le meilleur des cas, la fiabilité est de 97 à 98 % ; ce qui est déjà énorme. J'ai précisé plus haut que ces expériences sont locales. En effet, les résultats validés par une comparaison avec l'ADN ne peuvent s'appliquer que localement et doivent être réajustés quand on change de région, car le milieu et l'évolution des populations influencent la morphologie des souris.

Par conséquent, puisqu'il est quasiment impossible de distinguer les deux souris et que les deux espèces sont présentes dans le sud du Québec, j'ai arbitrairement ajouté la souris à pattes blanches (Peromyscus leucopus) à liste du guide des mammifères du Boisé du Tremblay.

Références:

• A. Garcia-Elfring, « Admixture on the northern front: population genomics of the white-footed mouse (Peromyscus leucopus) in Quebec and evidence of hybridization with the deer mouse (Peromyscus maniculatus) ». 
• A. Chénard, « Discrimination de Peromyscus Leucopus et Peromyscus Maniculatus à partir de mesures morphologiques ». 
• J. E. Sternburg et G. A. Feldhamer, « Mensural discrimination between sympatric Peromyscus leucopus and P. maniculatus in southern Illinois ». 
• S. S. T. Leo et V. Millien, « Microsatellite markers reveal low frequency of natural hybridization between the white-footed mouse ( Peromyscus leucopus ) and deer mouse ( Peromyscus maniculatus ) in southern Quebec, Canada », Genome, vol. 60, n^o 5, p. 454‑463, mai 2017. 
• P. J. Fiset, « Phylogéographie comparée de la souris à pattes blanches et de la souris sylvestre, deux vecteurs de la maladie de Lyme au Québec ».